Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CLIP4Q8N3C7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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