Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms