Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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