Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms