Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms