Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms