Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM236Q5W0B7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms