Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM69BQ5VUD6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms