Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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