Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PROX2Q3B8N5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms