Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms