Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC96Q2M329 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC96Q2M329 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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