Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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