Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LAMA3Q16787 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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