Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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