Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC37Q16543 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms