Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPE65Q16518 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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