Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF2Q15853 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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