Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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NECTIN1Q15223 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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NECTIN1Q15223 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NECTIN1Q15223 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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