Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC3Q15034 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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