Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms