Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms