Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBFBQ13951 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBFBQ13951 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms