Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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ATP1A4Q13733 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ATP1A4Q13733 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP1A4Q13733 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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