Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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