Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCIRG1Q13488 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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