Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD4Q13485 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD4Q13485 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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