Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XRCC4Q13426 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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