Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SGCGQ13326 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCGQ13326 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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