Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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