Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF1Q13077 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms