Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STRN3Q13033 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms