Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSTF3Q12996 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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