Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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