Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIF5AQ12840 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms