Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC20Q12834 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC20Q12834 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms