Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP4Q09028 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms