Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLFN5Q08AF3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms