Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD300CQ08708 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms