Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DDR1Q08345 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DDR1Q08345 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms