Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
POLEQ07864 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms