Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms