Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms