Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms