Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms