Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms