Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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