Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMAD3P84022 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAD3P84022 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms