Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRX1P78414 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms