Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms